Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms