Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms