Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms