Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdx4Q07424 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms