Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms