Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms