Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms