Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a1Q04857 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a1Q04857 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms