Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Emx1Q04742 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms