Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms