Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl7Q03366 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms