Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfiaQ02780 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms