Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms