Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgcrQ01237 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms