Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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