Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms