Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms