Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms