Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
rp9P97762 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
rp9P97762 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
rp9P97762 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
rp9P97762 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
rp9P97762 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
rp9P97762 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
rp9P97762 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
rp9P97762 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
rp9P97762 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
rp9P97762 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms