Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms