Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms