Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Mesp1P97309 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms