Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms