Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms