Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms