Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NficP70255 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NficP70255 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NficP70255 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NficP70255 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms