Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrig1P70193 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrig1P70193 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms