Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms