Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms