Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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P58686 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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P58686 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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P58686 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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P58686 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P58686 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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P58686 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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P58686 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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P58686 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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P58686 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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P58686 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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P58686 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P58686 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms