Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms