Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp25P57080 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp25P57080 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp25P57080 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp25P57080 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp25P57080 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms