Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms