Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms