Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cux1P53564 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cux1P53564 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cux1P53564 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cux1P53564 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cux1P53564 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cux1P53564 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cux1P53564 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cux1P53564 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms