Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms