Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms