Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms