Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms