Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms