Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf1P39428 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms