Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn12P35831 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms