Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stfa1P35175 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms