Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms