Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rom1P32958 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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