Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrm4P32211 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrm4P32211 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms