Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcdP28867 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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