Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NapbP28663 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NapbP28663 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NapbP28663 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NapbP28663 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NapbP28663 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NapbP28663 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NapbP28663 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NapbP28663 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NapbP28663 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NapbP28663 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NapbP28663 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NapbP28663 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms