Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms