Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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